Alien Trilogy ist ein First-Person-Shooter, der auf den ersten drei Alien-Filmen basiert. Sie steuern Lt. Ripley in drei Abschnitten, die jeweils auf einem Film basieren: Der Koloniekomplex auf LV426 (aus Aliens), der Gefängnisplanet (aus Alien³) und das verlassene Raumschiff (aus Alien). Jeder Abschnitt besteht aus etwa 10 Missionen. In jeder Mission müssen bestimmte Ziele erreicht werden, um fortzufahren. Dazu gehören das Töten einer bestimmten Anzahl von Feinden, das Finden von Gegenständen oder das Aktivieren von Schaltern. Zu den Gegnern gehört alles, was der Alien-Lebenszyklus hergibt: Facehugger, Chestburster, Warrior-Aliens, Dog-Aliens (aus Alien³) und Alien-Queens, von denen eine in der letzten Mission jedes Abschnitts wartet. Neben den Aliens müssen Sie auch gegen Mitarbeiter der Firma kämpfen, die entweder von den Aliens infiziert wurden und nicht mehr zu retten sind oder die Ihre Mission aktiv behindern wollen. Als Waffen stehen Ihnen Pistole, Schrotflinte, Impulsgewehr, Flammenwerfer und Smartgun zur Verfügung. Munition, Gesundheits-Upgrades und andere nützliche Gegenstände sind in den Levels verstreut. Versteckte Bereiche können durch den Einsatz von Sprengstoffen wie Granaten und seismischen Ladungen aufgedeckt werden. Ein Auto-Mapping-System hilft dabei, sich nicht zu verirren, Nachtsichtbrillen und Schulterlampen (die mit Batteriestrom betrieben werden) ermöglichen es Ihnen, im Dunkeln zu sehen, und der Motion-Tracker sagt Ihnen, wo sich Ihre Feinde befinden allerdings nur, wenn sie sich bewegen.
