Am 6.Dezember 1992 kommt es in Tokio zu einer Explosion einer Atombombe, die den dritten Weltkrieg auslöst.
38 Jahre später beginnt der Manga 'Akira'.
Kaneda und Tetsuo fahren mit ihrer Motorradgang verbotener Weise zu dem alten Explosionskrater. Auf der Rückfahrt verunglückt Tetsuo schwer, weil sich ihm ein altes Männchen in den Weg stellt, welches sich kurz darauf in Luft auflöst. Tetsuo wird vom Militär, das sich kurz darauf einstellt, in ein Krankenhaus gebracht. Es stellt sich allerdings heraus, dass niemand weiß, wohin sie ihn gebracht haben.
Noch während Kaneda und seine Gang darüber rätseln, lernen sie die Untergrundbewegung um Kei und Ryusako kennen und legen sich dadurch sofort mit dem Militär an. Schmerzhaft finden sie heraus, dass alle hinter diesem kleinen Mädchen, Takashi, her sind. Es gehörte als Kind zu einer Gruppe, die übernatürliche Kräfte entwickelten können.
Als Tetsuo dann zurückkehrt, beginnt er ebenfalls, zunächst schwach, dann immer stärker, diese Kräfte zu entwickeln, wird aber immer wieder von starken Kopfschmerzen heimgesucht, weil er diese Kräfte nicht beherrschen kann.
Aufgrund seiner Kräfte beginnt er jedoch, Kaneda die Position als Gangleader streitig zu machen. Als dieser sich wehrt, macht sich Tetsuo zum Führer einer verfeindeten Gang, den Clowns, indem er deren Führer tötet.
Inzwischen kann Tetsuo seine Kräfte nur noch unter Kontrolle halten,wenn er starke Drogen nimmt oder seine Kräfte freisetzt, indem er andere damit tötet. Dann allerdings hört er von einem anderen starken PSI-begabten, Akira, und beschließt, sich mit ihm zu messen. Allerdings ist Akira nach einem 'Zwischenfall' vom Militär im wahrsten Sinne des Wortes auf Eis gelegt. Tetsuo schafft es aber, Akira aufzuwecken und beschwört damit eine neue Katastrophe über Neu-Tokio herauf.
